近日，水稻耐高溫課題組系統鑒定了水稻高溫脅迫下長鍊非編碼RNA（Long non-coding RNA, lncRNAs）的調控網絡，繪制了lncRNAs應答熱脅迫的綜合圖譜。相關結果以“Global identifcation and integrated analysis of heat-responsive long non-coding RNAs in contrasting rice cultivars”為題發表于Theoretical and Applied Genetics雜志。
長鍊非編碼RNA在植物發育及對環境脅迫的響應中起着至關重要的作用，系統識别和理解lncRNAs介導的基因互作網絡是解析和改良農作物複雜性狀的理論基礎。本研究對高溫耐受性不同的水稻品種進行了鍊特異性RNA測序，鑒定了2743個lncRNAs，構建了其在熱處理後的綜合表達圖譜；基于lncRNA與靶基因的互作模式（順式作用、内源競争生RNA、miRNA前體和反義RNA等），構建了熱脅迫響應lncRNA（Heat Responsive LncRNAs, HRLs）與mRNA、小RNA的互作網絡；對HRLs進行了功能注釋；HRLs及靶基因與熱脅迫下水稻幼苗生長相關遺傳位點的整合分析為不同RNA分子在熱脅迫響應中的互作功能提供了進一步證據；熱脅迫相關lncRNA序列模體的顯著富集為後期利用基因編輯等手段研究HRLs的功能提供了重要候選靶點。該研究為進一步闡釋lncRNAs調控植物熱脅迫應答的功能和植物耐熱性遺傳改良提供了寶貴的資源和理論基礎。
華中師範大學張征鋒老師和我院已畢業碩士鐘華華為該論文第一作者，肖本澤老師為該論文通訊作者。論文修改中得到了謝卡斌教授的幫助，該研究得到了國家轉基因專項(2016ZX08001-003)的資助。
論文鍊接：https://rd.springer.com/article/10.1007%2Fs00122-021-04001-y
