遺傳教研室
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劉智捷
作者:審核:編輯:發布時間:2017-02-22

基本信息

姓名: 劉智捷 出生年月: 1984.12
性别: 碩/博導:
民族: 開設課程: 普通遺傳學;普通遺傳學實驗
職稱: 講師 研究方向: 玉米抗逆分子生物學
學位: 理學博士

聯系方式
辦公電話:18207192678
電子郵件:zhijie5.liu@gmail.com

個人簡介
1. 碩士期間參與了“逆境條件下玉米苗期根系miRNA的表達與調控機理研究”,利用小RNA芯片技術鑒定高鹽脅迫和低氧脅迫下誘導表達的miRNA,從中建立了miRNA與淹水、高鹽逆境的關系,并進一步對miRNA參與的逆境響應通路進行了推測和分析。相關研究成果分别在2008年[5]和2009年[6]均發表于Annals of Botany雜志上。
2. 2008年以碩博連讀的培養方式轉入到博士期間的學習,并經鄭用琏教授推薦到美國冷泉港Doreen Ware教授實驗室交流學習三年,期間主要進一步深入探讨miRNA對漬水逆境的響應及其調控途徑。通過高通量測序技術對miRNA的表達量進行了深入的定量分析;利用qPCR對miRNA以及其下遊靶基因的表達進行了進一步的确認;分析了miRNA基因啟動子區的順式作用元件,構建了miRNA介導的、玉米根系細胞響應短期漬害脅迫的基因表達調控網絡,闡述了miRNA在短期漬害逆境條件下參與的代謝及信号通路,并提出了miRNA介導的玉米根系細胞響應漬害的“節能假說”。相關研究成果以第一作者發表在PLoS One雜志上[4]。
3. 在冷泉港的三年期間,也參與了其他課題的研究工作:
1)參與了玉米基因組測序計劃,構建了部分測序文庫,為玉米B73全基因組測序提供了實驗材料和分析數據。相關工作于2009年作為封頁文章發表于Science雜志上[1]。
2)構建了5個玉米不同組織的小RNA文庫,用于高通量測序。學習并參與了後期的數據分析。研究結果于2009年發表于PLoS Genetics雜志上[3]。
3)參與了拟南芥轉錄因子文庫的構建工作中,共構建了由712轉錄因子所構成的轉錄因子文庫。利用這一文庫篩選了玉米以及拟南芥miRNA的啟動子,構建了miRNA的調控網絡。部分結果于2011年發表于Nature Method雜志上[2]。
4. 開展了玉米冠根中miRNA對長期淹水逆境脅迫響應的機理研究,參與了數據分析及論文的撰寫、修改。研究結果進一步證實了所提出的miRNA介導的漬害響應“節能假說”,并以并列第一作者身份于2012年發表于Physiologia Plantarum雜志上[7]。

科研項目

發明專利及獲獎情況

發表的論文及著作
第一作者發表:
1. Liu Z, Kumari S, Zhang L, Zheng Y*, Ware D*. Characterization of miRNAs in response to short-term waterlogging in three inbred lines of Zea mays. PLoS One, 2012;7(6):e39786. Epub 2012 Jun 29.
2. Zhai L, Liu Z, Zou X, Jiang Y, Qiu F, Zheng Y, Zhang Z*: Genome-wide Identification and Analysis of MicroRNA Responding to Long-Term waterlogging in Crown Roots of Maize Seedlings. Physiologia Plantarum, 2012. doi: 10.1111/j. 1399-3054. 2012. 01653. x.(
并列第一作者)

合作作者發表:
1. Schnable PS, Ware D, Fulton RS, Stein JC, Wei F, Pasternak S, Liang C, Zhang J, Fulton L, Graves TA, Minx P, Reily AD, Courtney L, Kruchowski SS, Tomlinson C, Strong C, Delehaunty K, Fronick C, Courtney B, Rock SM, Belter E, Du F, Kim K, Abbott RM, Cotton M, Levy A, Marchetto P, Ochoa K, Jackson SM, Gillam B, Chen W, Yan L, Higginbotham J, Cardenas M, Waligorski J, Applebaum E, Phelps L, Falcone J, Kanchi K, Thane T, Scimone A, Thane N, Henke J, Wang T, Ruppert J, Shah N, Rotter K, Hodges J, Ingenthron E, Cordes M, Kohlberg S, Sgro J, Delgado B, Mead K, Chinwalla A, Leonard S, Crouse K, Collura K, Kudrna D, Currie J, He R, Angelova A, Rajasekar S, Mueller T, Lomeli R, Scara G, Ko A, Delaney K, Wissotski M, Lopez G, Campos D, Braidotti M, Ashley E, Golser W, Kim H, Lee S, Lin J, Dujmic Z, Kim W, Talag J, Zuccolo A, Fan C, Sebastian A, Kramer M, Spiegel L, Nascimento L, Zutavern T, Miller B, Ambroise C, Muller S, Spooner W, Narechania A, Ren L, Wei S, Kumari S, Faga B, Levy MJ, McMahan L, Van Buren P, Vaughn MW, Ying K, Yeh CT, Emrich SJ, Jia Y, Kalyanaraman A, Hsia AP, Barbazuk WB, Baucom RS, Brutnell TP, Carpita NC, Chaparro C, Chia JM, Deragon JM, Estill JC, Fu Y, Jeddeloh JA, Han Y, Lee H, Li P, Lisch DR, Liu S, Liu Z, Nagel DH, McCann MC, SanMiguel P, Myers AM, Nettleton D, Nguyen J, Penning BW, Ponnala L, Schneider KL, Schwartz DC, Sharma A, Soderlund C, Springer NM, Sun Q, Wang H, Waterman M, Westerman R, Wolfgruber TK, Yang L, Yu Y, Zhang L, Zhou S, Zhu Q, Bennetzen JL, Dawe RK, Jiang J, Jiang N, Presting GG, Wessler SR, Aluru S, Martienssen RA, Clifton SW, McCombie WR, Wing RA, Wilson RK*: The B73 maize genome: complexity, diversity, and dynamics. Science 326(5956): 1112-1115, 2009.
2. Gaudinier A, Zhang L, Reece-Hoyes JS, Taylor-Teeples M, Pu L, Liu Z, Breton G, Pruneda-Paz JL, Kim D, Kay SA, Walhout AJM, Ware D, Brady SM. Enhanced Y1H assays for Arabidopsis. Nature methods, 2011. 8: 1053-1055.
3. Zhang L, Chia JM, Kumari S, Stein JC, Liu Z, Narechania A, Maher CA, Guill K, McMullen MD, Ware D*: A genome-wide characterization of microRNA genes in maize. PLoS Genet 5(11): e1000716, 2009.
4. Zhang Z, Wei L, Zou X, Tao Y, Liu Z, Zheng Y*: Submergence-responsive MicroRNAs are potentially involved in the regulation of morphological and metabolic adaptations in maize root cells. Ann Bot 102(4): 509-519, 2008. 被引用次數:37. IF (2008): 3.501
5. Ding D, Zhang L, Wang H, Liu Z, Zhang Z, Zheng Y*: Differential expression of miRNAs in response to salt stress in maize roots. Ann Bot 103(1): 29-38, 2009.

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